あちゃ〜！すごい世界になりました。次々とシビれる論文が出てきます。

AIの発展によって、バイオロジーは「黄金時代」に突入しそうな予感がします。今回の論文では数千もの動物や人間の組織から得られた「全遺伝子発現パターン」をAIに見せ、「実際の年齢や死亡リスク」を教えて教師付き機械学習させた、というものです。このAIにRNAseqの結果を放り込むと、「あなたのトランスクリプトーム年齢は〇〇歳、死亡リスクはこれくらい」と弾き出すそうです。健康診断で「病気なし、異常なし」と言われていても、AIは、近い将来に心不全や脳卒中、腎不全を発症する「多疾患罹患リスク」を告げることができるというわけです。

このAIの不気味な信頼性はマウスもサルもヒトも共通の老化特異的なトランスクリプトームを示すということからも伺えます。ちょっと前に、若いマウスと年老いたマウスを腹腔部分で接合して一つの個体にする（パラバイオーシス）と老齢マウスが若返るという論文がありましたが、続報がないので眉唾？と疑っていたのですが、なんとその論文で公開されていた遺伝子発現の結果をこのAIで解析すると老齢マウスの肝臓でNrepの増加や炎症関連のCdkn1aの減少として若返りが証明されたそうです。へ〜っ！

トランスクリプトーム測定は皮膚でも肝臓でも血液でも、シングルセルでも組織全体でも何でも良いそうです。新発見の遺伝子はありませんが、長寿に関連するFmo3やNmrk1、短命マーカーのCpなどの重要性がクローズアップされています。

寿命のわかる世界へのパラダイムチェンジ！生命保険はこの先どうなるんですかねえ？ あなたの生命のロウソクが、あと何センチ残っているのか。 正確なところをAIに教えてもらいたいですか？

腎臓が悪くなって死亡する場合、腎臓のトランスクリプトーム年齢は高くなっているハズなので、正確には各臓器を調べる必要があるのではないかと思いますよね。でもそれは人間の脳向けの“reductionism”の考え方です。その考え方は古いというのがこの論文の意味するところだと思います。

人間にはできませんが、AIは何万もの遺伝子すべてを同時に見ることができます。仮に腎臓から老化が始まると、それは全身に波及してtranscriptomeの変化としてとらえることができる。だから特定の臓器を全部調べなくても血液を調べるだけでわかるということになるんだそうです。

「網羅的研究」という文言を科研費の題名にいれたりしてましたが、人間の頭脳レベルではナンチャッテ「網羅的研究」に過ぎなかったということでしょう。

AI頭脳による網羅的研究は今後も蓄積され、蓄積が進むと、例えば、先日の胎盤の遺伝子マッピングと今回の老化トランスクリプトームなど網羅的研究同士をAIを使って関連づける方向に進むと思います。

近い将来、研究の種がなくなるんじゃないでしょうか？？？？ どう思われますか？

AIに学習させたデータに「胚」は含まれていなかったのですが、初期胚のRNA-seqをTACO-AIで分析したところ、E10までの間は初期化（若くなる）が進み、それ以降は年齢が上昇してゆくという結果になったそうです。

面白いのは発生10日目までの「若返り変化」に胎盤は含まれてなかったという点です。胎盤は分化の終点なので初期化しないほうがいいということかもしれません。E10 は色んな意味で体の出発点であり心臓も脳も手足も原基ができるような時期なので最も若いポイントが与えられるのは当然なのかもしれません。TACO-AIは見る目があるなというふうに思います。

TACO-AIが遺伝子発現パターンのまるで違う白血球とブラストシストのRNAseqを同列扱えるのは、AIにデータを入力する際に、相対的な変化しか与えていないというのが大きいかもしれません。相対値だけなので、AIはそれが白血球なのか初期胚なのかを知る方法はありません。なので寿命だけに専念して考えることができるということです。

KOで不妊にした場合、その精巣の死亡率クロックってどうなるんですかね？またそれは個体の死亡率クロックに影響を与えうるんですかねえ？与えなさそうに思いますが、長生きする方に動くのか、逆に動くのかはやってみないとわかりませんね。iPSの年齢はどのくらいの若さなんでしょう？医療用に分化させたものの年齢はどのくらい？若山さんの２０年間クローンで継代し続けて死亡するようになったマウスの一代前のマウスはどういう判定を受けるんでしょう？

いろんな問いが湧いてきます。スゴイ論文です！ TACO-AI はオンラインで公開されているのでRNAseqを持っているヒトはだれでも試せるというのもスゴイです。 是非、お試しあれ！

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